１１日午後１１時５０分頃、新潟県村上市長政の米菓製造大手「三幸製菓」（本社・新潟市北区）の荒川工場から出火したと、警備会社を通じて１１０番があった。アルバイトの女性４人が心肺停止の状態で発見され、いずれも搬送先の病院で死亡が確認された。２０歳代の男性２人と連絡が取れておらず、このうち１人とみられる遺体が焼け跡から見つかった。ほかに５０歳代の女性１人が煙を吸って病院に搬送されたが、命に別条はないという。
県警村上署の発表によると、死亡したのは渡辺芳子さん（７１）（村上市長政）、伊藤美代子さん（６８）（同県胎内市下館）、近ハチヱさん（７３）（同市東牧）、斎藤慶子さん（７０）（同市土作）。４人は工場内の清掃を担当していたという。
同社などによると、荒川工場は２４時間体制の３交代制。出火当時は深夜番の時間帯で、従業員ら三十数人がいた。同工場は敷地面積約７・８ヘクタールで、商品の製造ラインごとに複数の建物がある。火災が起きた建物では、生地を練ったり、焼いたりする工程があるという。

現場は村上市役所から南に約１５キロのＪＲ羽越線沿いの田園地帯。消防車両約２０台が出動し、出火から約１１時間半後の１２日午前１１時１０分に鎮火した。出火した建物の目の前にある寮で就寝していた男性（２１）は「『避難して』とドアをノックされて火事に気づいた。出火した建物のシャッターの隙間から黒い煙がたくさん出ていた」と振り返った。
「雪の宿」や「ぱりんこ」などの米菓で知られる同社の工場は県内に三つあり、荒川工場は１９８２年に操業を始めた。同社は「工場では商品製造から箱詰めまでやっている。出火原因の究明と再発防止に努めたい。本当に申し訳ない」とコメントした。