２７日午後５時４０分頃、港湾工事関係者から「屋久島に回航中だった作業船が転覆した」と第１０管区海上保安本部に通報があった。
鹿児島海上保安部などが巡視船や航空機で捜索。通報から約２２時間後の２８日午後３時半頃、鹿児島県屋久島町尾之間港から南東に約３０キロの沖合で、ひっくり返った状態の作業船（５トン未満）を発見。船底に乗っていた男性船長（６９）を救助した。男性は鹿児島市内の病院に搬送されたが、意識はあり、命に別条はないという。
同保安部によると、男性は１人で乗船。ビニールシートで体を覆うなどして体温低下を防ぎ、スクリューにしがみつき海に落ちないようにしていたという。