九州南部を北上している梅雨前線に暖かく湿った空気が流れ込んだ影響で、２０日午前、九州を中心に激しい雨が降った。熊本県天草市などには、避難情報の運用変更後初めて警戒レベル４の「避難指示」が発令された。
水害や土砂災害時に自治体が出す避難情報は２０日から、災害対策基本法の改正に伴い、これまで警戒レベル４で出していた避難勧告と避難指示の併用を改め、指示に一本化するなど運用が変更された。
天草市は２０日午前９時、土砂災害発生の恐れが非常に高まっているとして、市内の牛深町、久玉町、深海町、御所浦町の６７５３世帯、１万２９２４人を対象に警戒レベル４の避難指示を発令した。同県芦北町、津奈木町、水俣市でも避難指示が発令された。
気象庁によると、熊本県山江村で２０日午前、１時間に５４ミリの雨を観測するなど熊本、鹿児島両県を中心に激しい雨に見舞われている。
気象庁によると、西日本と東日本の広い範囲で２１日にかけて大雨が予想されており、２１日午前６時までに予想される２４時間降水量は九州、四国、近畿で２５０ミリ、東海で２００ミリなど。同庁は、土砂災害や低い土地の浸水、河川の増水・氾濫に警戒するよう呼びかけている。